Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Speer4bQ9D9F7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Speer4bQ9D9F7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Speer4bQ9D9F7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4bQ9D9F7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms