Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc70Q9D9B0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms