Protein–RNA interactions for Protein: Q9D924

Isca1, Iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isca1Q9D924 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Isca1Q9D924 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Isca1Q9D924 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms