Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo2Q9D8S4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo2Q9D8S4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms