Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin37Q9D8N6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin37Q9D8N6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin37Q9D8N6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin37Q9D8N6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin37Q9D8N6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin37Q9D8N6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms