Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.2 ms