Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2af1Q9D883 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af1Q9D883 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms