Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms