Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms