Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kctd4Q9D7X1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kctd4Q9D7X1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms