Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp5Q9D7S9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms