Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms