Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Capns2Q9D7J7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms