Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp4cQ9D7F7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms