Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf13Q9D777 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms