Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Nop56Q9D6Z1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Nop56Q9D6Z1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Nop56Q9D6Z1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Nop56Q9D6Z1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nop56Q9D6Z1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nop56Q9D6Z1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nop56Q9D6Z1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nop56Q9D6Z1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop56Q9D6Z1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop56Q9D6Z1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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