Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lpcat2bQ9D5U0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lpcat2bQ9D5U0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lpcat2bQ9D5U0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lpcat2bQ9D5U0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms