Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms