Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms