Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn11Q9D572 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms