Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7Q9D541 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc7Q9D541 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms