Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lonrf3Q9D4H7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms