Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933421I07RikQ9D420 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms