Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700034E13RikQ9D2T6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms