Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms