Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MrnipQ9D1F5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MrnipQ9D1F5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms