Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TbcbQ9D1E6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TbcbQ9D1E6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms