Protein–RNA interactions for Protein: Q9D112

Uncharacterized protein C20orf196 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D112 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D112 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D112 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D112 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D112 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D112 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D112 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D112 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D112 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D112 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D112 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D112 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D112 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D112 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D112 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D112 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D112 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D112 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D112 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D112 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D112 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D112 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D112 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D112 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D112 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D112 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D112 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D112 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D112 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D112 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D112 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D112 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D112 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D112 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D112 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D112 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D112 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D112 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D112 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D112 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D112 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D112 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms