Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cmss1Q9CZT6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms