Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms