Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snf8Q9CZ28 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snf8Q9CZ28 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms