Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins3Q9CY94 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins3Q9CY94 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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