Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChtopQ9CY57 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChtopQ9CY57 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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