Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx7Q9CY18 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms