Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CXL3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms