Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nip7Q9CXK8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms