Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sgo1Q9CXH7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sgo1Q9CXH7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sgo1Q9CXH7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sgo1Q9CXH7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sgo1Q9CXH7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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