Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms