Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mgme1Q9CXC3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms