Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms