Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup37Q9CWU9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms