Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Tdrd12Q9CWU0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Tdrd12Q9CWU0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Tdrd12Q9CWU0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Tdrd12Q9CWU0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms