Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms