Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd1Q9CR42 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms