Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms