Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rpl39lQ9CQD0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rpl39lQ9CQD0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rpl39lQ9CQD0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rpl39lQ9CQD0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpl39lQ9CQD0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rpl39lQ9CQD0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Rpl39lQ9CQD0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rpl39lQ9CQD0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rpl39lQ9CQD0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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