Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc5Q9CQA1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Trappc5Q9CQA1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Trappc5Q9CQA1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Trappc5Q9CQA1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms