Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp2Q9CQ73 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms