Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms