Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pole4Q9CQ36 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms